Identificación de mutaciones somáticas implicadas en los mecanismos de sensibilidad y/o resistencia a fármacos dirigidos en tumores sólidos

Línea de investigación

Investigar y entender los tejidos es la base para entender las enfermedades en su globalidad

Miriam Cuatrecasas

Jefe de Sección Patología Torácica, Digestiva y Metabólica

Presentación

Problema

Las neoplasias humanas y las enfermedades inflamatorias tienen unos mecanismos genéticos y moleculares implicados en su desarrollo y progresión que se pueden conocer mediante técnicas moleculares y digitales aplicadas a los tejidos.

investigacion

 

Aproximación

Las plataformas tecnológicas aplicadas a la investigación de las enfermedades inflamatorias y los tumores humanos permiten transferir a la práctica clínica los conocimientos generados en la investigación básica.

Por este motivo, a nivel diagnóstico se utilizan técnicas de patología molecular aplicadas, que incluyen genética, epigenética, proteómica, glicómica y patología digital con algoritmos de inteligencia artificial, microscopía espectral y confocal ex vivo.

Impacto

Gracias a la identificación de dianas terapéuticas, el grupo ha distinguido parámetros que permiten mejorar el diagnóstico y el pronóstico de la enfermedad inflamatoria y neoplásica.

El grupo es líder en diagnóstico molecular de carcinoma de pulmón, mama y estadificación molecular ganglionar en cáncer colorrectal, así como en mecanismos moleculares subyacentes a los procesos inflamatorios cutáneos y renales, técnicas de caracterización molecular en melanoma y tumores del sistema nervioso central.

Miembros del equipo

Miriam Cuatrecasas
Iban Aldecoa
Llucia Alos
Paola Cecilia Castillo Fernández
Adriana García-Herrera
Carme Mallofre
Alfons Nadal
José Francisco Ramírez
Teresa Ribalta
Adela Saco
Sherley Diaz
Esther Sanfeliu
Cristina Teixido

Publicaciones

ERBB2 mRNA Expression and Response to Ado-Trastuzumab Emtansine (T-DM1) in HER2-Positive Breast Cancer.

Griguolo G, Brasó-Maristany F, González-Farré B, Pascual T, Chic N, Saurí T, Kates R, Gluz O, Martínez D, Paré L, Tsvetkova V, Pesantez D, Vidal M, Adamo B, Muñoz M, Galván P, Barberá L,Cuatrecasas M, Christgen M, Kreipe H, Monge-Escartín I, Villagrasa P, Soy D, Giarratano T, Dieci MV, Conte P, Harbeck N, Guarneri V, Prat A. Cancers (Basel). 2020 Jul 14;12(7):1902. doi: 10.3390/cancers12071902.

 

Usefulness of Two Independent DNA and RNA Tissue-Based Multiplex Assays for the Routine Care of Advanced NSCLC Patients.

Marin E, Teixido C, Carmona-Rocha E, Reyes R, Arcocha A, Viñolas N, Rodríguez-Mues M, Cabrera C, Sánchez M, Vollmer I, Castillo S, Muñoz S, Sullivan IG, Rodriguez A, Garcia M, Alos S, Jares P, Martinez A, Prat A, Molina-Vila MÁ, Reguart N. Cancers (Basel). 2020 Apr 30;12(5):1124. doi: 10.3390/cancers12051124.

 

Integrated Analysis of Germline and Tumor DNA Identifies New Candidate Genes Involved in Familial Colorectal Cancer.

Díaz-Gay M, Franch-Expósito S, Arnau-Collell C, Park S, Supek F, Muñoz J, Bonjoch L, Gratacós-Mulleras A, Sánchez-Rojas PA, Esteban-Jurado C, Ocaña T, Cuatrecasas M, Vila-Casadesús M, Lozano JJ, Parra G, Laurie S, Beltran S; EPICOLON Consortium, Castells A, Bujanda L, Cubiella J, Balaguer F, Castellví-Bel S.Cancers (Basel). 2019 Mar 13;11(3):362. doi: 10.3390/cancers11030362.

 

AURKB as a target in non-small cell lung cancer with acquired resistance to anti-EGFR therapy.

Bertran-Alamillo J, Cattan V, Schoumacher M, Codony-Servat J, Giménez-Capitán A, Cantero F, Burbridge M, Rodríguez S, Teixidó C, Roman R, Castellví J, García-Román S, Codony-Servat C, Viteri S, Cardona AF, Karachaliou N, Rosell R, Molina-Vila MA.Nat Commun. 2019 Apr 18;10(1):1812. doi: 10.1038/s41467-019-09734-5.

 

Assessment of a New ROS1 Immunohistochemistry Clone (SP384) for the Identification of ROS1 Rearrangements in Patients with Non-Small Cell Lung Carcinoma: the ROSING Study.

Conde E, Hernandez S, Martinez R, Angulo B, De Castro J, Collazo-Lorduy A, Jimenez B, Muriel A, Mate JL, Moran T, Aranda I, Massuti B, Rojo F, Domine M, Sansano I, Garcia F, Felip E, Mancheño N, Juan O, Sanz J, Gonzalez-Larriba JL, Atienza-Cuevas L, Arriola-Arellano E, Abdulkader I, Garcia-Gonzalez J, Camacho C, Rodriguez-Abreu D, Teixido C, Reguart N, Gonzalez-Piñeiro A, Lazaro-Quintela M, Lozano MD, Gurpide A, Gomez-Roman J, Lopez-Brea M, Pijuan L, Salido M, Arriola E, Company A, Insa A, Esteban-Rodriguez I, Saiz M, Azkona E, Alvarez R, Artal A, Plaza ML, Aguiar D, Enguita AB, Benito A, Paz-Ares L, Garrido P, Lopez-Rios F.J Thorac Oncol. 2019 Dec;14(12):2120-2132. doi: 10.1016/j.jtho.2019.07.005. 

Gene Expression Signature in Surgical Tissues and Endoscopic Biopsies Identifies High-Risk T1 Colorectal Cancers.

Kandimalla R, Ozawa T, Gao F, Wang X, Goel A; T1 Colorectal Cancer Study Group.Gastroenterology. 2019 Jun;156(8):2338-2341.e3. doi: 10.1053/j.gastro.2019.02.027. 

 

Clinical Benefit From BRAF/MEK Inhibition in a Double Non-V600E BRAF Mutant Lung Adenocarcinoma: A Case Report.

Reyes R, Mayo-de-Las-Casas C, Teixidó C, Cabrera C, Marín E, Vollmer I, Jares P, Garzón M, Molina-Vila MÁ, Reguart N.Clin Lung Cancer. 2019 May;20(3):e219-e223. doi: 10.1016/j.cllc.2019.02.022.

 

DYRK1A modulates c-MET in pancreatic ductal adenocarcinoma to drive tumour growth.

Luna J, Boni J, Cuatrecasas M, Bofill-De Ros X, Núñez-Manchón E, Gironella M, Vaquero EC, Arbones ML, de la Luna S, Fillat C.Gut. 2019 Aug;68(8):1465-1476. doi: 10.1136/gutjnl-2018-316128. 

 

Targeted sequencing and molecular profiling of a papillary and cribriform clear cell intrahepatic cholangiocarcinoma reveals absence of selectable mutations.

Aldecoa I, Montironi C, Vargas GM, Nunes DA, Miquel R, Cuatrecasas M.Gastroenterol Hepatol. 2019 Jun-Jul;42(6):374-375. doi: 10.1016/j.gastrohep.2018.08.006. 

 

Accuracy of the Narrow-Band Imaging International Colorectal Endoscopic Classification System in Identification of Deep Invasion in Colorectal Polyps

Puig I, López-Cerón M, Arnau A, Rosiñol Ò, Cuatrecasas M, Herreros-de-Tejada A, Ferrández Á, Serra-Burriel M, Nogales Ó, Vida F, de Castro L, López-Vicente J, Vega P, Álvarez-González MA, González-Santiago J, Hernández-Conde M, Díez-Redondo P, Rivero-Sánchez L, Gimeno-García AZ, Burgos A, García-Alonso FJ, Bustamante-Balén M, Martínez-Bauer E, Peñas B, Pellise M, EndoCAR group, Spanish Gastroenterological Association and the Spanish Digestive Endoscopy Society.

Gastroenterology. 2019 Jan;156(1):75-87. doi: 10.1053/j.gastro.2018.10.004.  

 

DYRK1A modulates c-MET in pancreatic ductal adenocarcinoma to drive tumour growth

Luna J; Boni J; Cuatrecasas M; Bofill-De Ros X; Núñez-Manchón E; Gironella M; Vaquero EC; Arbones ML; De La Luna S; Fillat C.

Gut. 2019 Aug;68(8):1465-1476.  doi: 10.1136/gutjnl-2018-316128.

 

Mitotic polarization of transcription factors during asymmetric division establishes fate of forming cancer cells

Liu Y; Siles L; Lu X; Dean K; Cuatrecasas M; Postigo A; Dean D.

Nat Commun. 2018 Jun 21;9(1):2424.  doi: 10.1038/s41467-018-04663-1.

 

Near-tetraploid cancer cells show chromosome instability triggered by replication stress and exhibit enhanced invasiveness.

Wangsa D, Quintanilla I, Torabi K, Vila-Casadesús M, Ercilla A, Klus G, Yuce Z, Galofré C, Cuatrecasas M, Lozano JJ, Agell N, Cimini D, Castells A, Ried T, Camps J .

FASEB J. 2018 Jul;32(7):3502-3517.  doi: 10.1096/fj.201700247RR.

 

Rare germline copy number variants in colorectal cancer predisposition characterized by exome sequencing analysis

Franch-Expósito S, Esteban-Jurado C, Garre P, Quintanilla I, Duran-Sanchon S, Díaz-Gay M, Bonjoch L, Cuatrecasas M, Samper E, Muñoz J, Ocaña T, Carballal S, López-Cerón M, Castells A,, Vila-Casadesús M, Derdak S, Laurie S, Beltran S, Carvajal J, Bujanda L, Ruiz-Ponte C, Camps J, Gironella M, Lozano JJ, Balaguer F, Cubiella J, Caldés T, Castellví-Bel S EPICOLON consortium.

J Genet Genomics. 2018 Jan 20;45(1):41-45.  doi: 10.1016/j.jgg.2017.12.001.

 

World Endoscopy Organization Consensus Statements on Post-Colonoscopy and Post-Imaging Colorectal Cancer.

Rutter MD, Beintaris I, Valori R, Chiu HM, Corley DA, Cuatrecasas M, Dekker E, Forsberg A, Gore-Booth J, Haug U, Kaminski MF, Matsuda T, Meijer GA, Morris E, Plumb AA, Rabeneck L, Robertson DJ, Schoen RE, Singh H, Tinmouth J, Young GP, Sanduleanu S .

Gastroenterology. 2018 Sep;155(3):909-925.e3.  doi: 10.1053/j.gastro.2018.05.038.

 

Lymph node pooling: A feasible and efficient method of lymph node molecular staging in colorectal carcinoma

Rakislova N., Montironi C., Aldecoa I., Fernandez E., Bombi J., Jimeno M., Balaguer F., Pellise M., Castells A., Cuatrecasas M.

J Transl Med. 2017 Jan 14;15(1):14.  doi: 10.1186/s12967-016-1114-3.

 

Endoscopic tattooing of early colon carcinoma enhances detection of lymph nodes most prone to harbor tumor burden

Aldecoa I, Montironi C, Planell N, Pellise M, Fernandez-Esparrach G, Gines A, Delgado S, Momblan D, Moreira L, Lopez-Ceron M, Rakislova N, Martinez-Palli G, Balust J, Bombi JA, de Lacy A, Castells A, Balaguer F, Cuatrecasas M.

Surg Endosc. 2017 Feb;31(2):723-733.  doi: 10.1007/s00464-016-5026-3.  

 

Increased IFRD1 Expression in Human Colon Cancers Predicts Reduced Patient Survival.

Lewis MA, Sharabash N, Miao ZF, Lyons LN, Piccirillo J, Kallogjeri D, Schootman M, Mutch M, Yan Y, Levin MS, Castells A, Cuatrecasas M, Mills JC, Wang ZN, Rubin DC.

Dig Dis Sci. 2017 Dec;62(12):3460-3467.  doi: 10.1007/s10620-017-4819-0. 

Principales prestaciones utilizadas

Análisis de las mutaciones de BRAF, tejidos
Análisis de las mutaciones de EGFR, tejido
Análisis de las mutaciones de KRAS, tejido
Análisis MGMT para tumores cerebrales, tejidos
CISH. Virus Epstein-Barr (EBER), bloque parafina
Detección del Virus del Papiloma Humano (VPH) por PCR, muestra citológica o  tejido parafinado
Determinación de la inestabilidad en microsatélites en tumores sólidos
Determinación de mutaciones de C-KIT, bloque parafina
Determinación de mutaciones de IDH1, bloque parafina
Determinación de mutaciones de IDH2, bloque parafina
Determinación de mutaciones del gen PDGFRA, bloque parafina
Determinación de mutaciones del promotor de TERT, bloque parafina
Determinación genes de fusión de pulmón por nCounter (Nanostring)
Determinación por técnica OSNA 
Extracción de DNA / RNA, bloque de parafina
FISH ALK, bloque de parafina
FISH MDM2, bloque de parafina
FISH MET, bloque de parafina
FISH ROS1, bloque de parafina
FISH 1p/19q tumores cerebrales, bloque parafina
HER2 (Inmunohistoquímica), bloque parafina
ISH HER2, bloque parafina  
Microsatélites MSH2, MSH6, MLH1, PMS2 (Inmunohistoquímica)
P16 en tejido (Inmunohistoquímica), bloque parafina
Panel Oncomine Solid Tumor 22 (NGS), DNA tumoral
Test Prosigna, tejido tumoral de mama parafinado

Otras líneas estratégicas de investigación