Caracterización molecular de mecanismos de resistencia a los antibióticos
El aumento de la resistencia a los antibióticos es un problema de salud global relacionado con una elevada morbi-mortalidad.
Detección de genes de resistencia y/o detecciones de mutaciones:
La detección genotípica de los mecanismos de resistencia se realiza mediante amplificación y secuenciación de ácidos nucleicos (PCR).
Estudios de permeabilidad de membrana:
Los mecanismos asociados a la permeabilidad de membrana, como por ejemplo la sobreexpresión de bombas de expulsión o la pérdida de porinas, se realiza mediante extracción de proteínas de membrana y posterior electroforesis en geles de poliacrilamida.
Estudio de plásmidos portadores de genes de resistencia:
- Tipificación de plásmidos mediante PCR múltiple
- Estudio de transmisibilidad de plásmidos mediante ensayos de conjugación biparental
- Localización plasmídica de los genes de resistencia mediante separación en geles de agarosa mediante electroforesis en campo pulsado digeridas con la nucleasa S1 y su posterior hibridación con sondas específicas y marcadas con digoxigenina
Identificar la presencia de clones mayoritarios:
La identificación de los clones multiresistentes se realiza mediante el estudio de la secuencia tipo o MLST (Multi Locus Sequence Typing)
IR Biotyper:
La espectrofotometría de infrarrojos por transformada de Fourier al análisis epidemiológico que realiza el IRBiotyper permite caracterizar la relación clonal de aislados bacterianos en base al análisis de las vibraciones de los carbohidratos que se encuentran en las glicoproteínas y la cápsula externa de la mayoría de bacterias.
Secuenciación masiva del genoma y resistoma:
La secuenciación masiva del DNA y el RNA completo se realiza mediante MiSeq o/y Nanopore MinION
