Anatomía Patológica

Prosigna

 

Prosigna es un análisis molecular del cáncer de mama que usa la firma genética PAM50 para determinar el subtipo intrínseco del tumor, así como estimar con fiabilidad el riesgo de recurrencia de la enfermedad en un plazo de 10 años. El test clasifica el riesgo en un rango bajo, intermedio y alto, basado en una escala de 100 puntos.

Este está especialmente indicado en mujeres postmenopáusicas operadas de cáncer de mama en estadios I, II o IIIA y con receptores hormonales positivos.

 

Next Generation Sequencing en Tumores Sólidos

 

Oncomine FOCUS es un panel de NGS que permite evaluar la presencia de alteraciones genéticas en 52 genes relevantes para el diagnóstico o tratamiento de tumores sólidos, entre los cuales incluye el cáncer de pulmón, colon y melanoma.

El ensayo analiza la presencia de mutaciones hotspots (SNV, indels de 35 genes: AKT1, ALK, AR, BRAF, CDK4, CTNNB1, DDR2, EGFR, ERBB2, ERBB3, ERBB4, ESR1, FGFR2, FGFR3, GNA11, GNAQ, HRAS, IDH1, IDH2, JAK1, JAK2, JAK3, KIT, KRAS, MAP2K1, MAP2K2, MET, MTOR, NRAS, PDGFRA, PIK3CA, RAF1, RET, ROS1, SMO), Copy Number Variations (19 genes: AKT1, AR, BRAF, CCND1, CDK4, CDK6, EGFR, ERBB2, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, KIT, KRAS, MET, MYC, MYCN, PDGFRA, PIK3CA) y fusiones génicas (23 genes: ABL1, ALK, AKT3, AXL, BRAF, EGFR, ERBB2, ERG, ETV1, ETV4, ETV5, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, NTRK1, NTRK2, NTRK3, PDGFRA, PPARG, RAF1, RET, ROS1) a partir de de ADN y ARN en un solo flujo de trabajo.

 

Genotipado VPH

 

La genotipificación para el virus del papiloma humano de alto riesgo (VPH-AR) 16 y 18 ofrece al médico la capacidad de identificar a aquellas mujeres con mayor riesgo de desarrollar cáncer cervical. El test para el VPH de la plataforma cobas 4800 (Roche Diagnostics) es un sistema totalmente automatizado de PCR a tiempo real, validado por la FDA y que detecta por separado los genotipos 16 y 18 además de otros 12 genotipos de alto riesgo (31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 y 68) en muestras de citología líquida del área anogenital o de la región orofaríngea.

El ensayo de sonda de línea de la plataforma INNOLiPA® se basa en el principio de hibridación inversa y permite la identificación de 32 genotipos diferentes del VPH (6, 11, 16, 18, 26, 31, 33, 35, 39, 40, 42, 43, 44, 45, 51, 52, 53, 54, 56, 58, 59, 61, 62, 66, 67, 68, 70, 73, 81, 82, 83 y 89). El ensayo está diseñado para la detección simultánea de los diferentes genotipos y acepta muestras tanto de citología como de tejido parafinado.

 

Consulta diagnóstica en hematopatología

 

Somos un laboratorio especializado en el diagnóstico de cánceres hematológicos, entre los que se incluyen la leucemia, el linfoma y el mieloma. También actuamos como centro de referencia de diagnóstico para muchos ensayos clínicos nacionales e internacionales y damos servicio a más de 2 millones de habitantes.

El diagnóstico hematopatológico requiere de la integración de varias técnicas, aún más en los casos complejos que no encajan en una entidad concreta. Ponemos a disposición de los solicitantes todos nuestros recursos humanos y tecnológicos para llegar a un diagnóstico definitivo en estos casos,

La consulta diagnóstica permite integrar los resultados de las diferentes técnicas de biología molecular con la clínica y la histopatología. La amplia experiencia de los miembros de esta área de excelencia y la tecnología disponible nos convierte en el mejor centro para la revisión de casos a fin de realizar una confirmación diagnóstica y/o reevaluación de casos complejos.

 

Estudio de la función plaquetaria

 

El área de Hemostasia y Eritropatología dispone de dos equipos para el estudio de la agregación plaquetaria y de agregación y liberación del contenido de los gránulos intraplaquetarios, respectivamente. Ambas son técnicas altamente manuales y específicas, para las que se requiere personal experto y para las que somos centro de referencia a nivel estatal.

 

 

Consulta diagnóstica en nefropatología

 

Ofrecemos el mejor servicio de consulta y revisión diagnóstica de casos complejos tanto de patología de riñón nativo como patología del trasplante.

La consulta de nefropatología se realiza por patólogos expertos en patología renal. Conlleva la realización de procedimientos y tinciones adecuados en función del material recibido, la información del paciente y los hallazgos específicos del caso para determinar un diagnóstico. La interpretación diagnóstica óptima de una biopsia renal médica requiere la integración de los hallazgos de la microscopía óptica, la inmunofluorescencia y la microscopía electrónica junto con los datos clínicos y de laboratorio del paciente. Para la evaluación diagnóstica y el informe final de las enfermedades renales no neoplásicas se siguen las más actualizadas guías de patología renal.

Técnicas destacadas:

• Tinciones especiales: ácido periódico de Schiff (PAS), tricrómico de Masson y metenamina-plata de Jones
• Inmunofluorescencia: IgA, IgG, IgM, C1q, C3, C4d,fibrinógeno, cadena ligeras ligeras kappa y lambda
• Subtipificación de IgG: IgG1 (IFD), IgG2 (IFD), IgG3 (IFD) e IgG4 (IHQ)
• Inmunonohistoquímica: PLA2R, AntiTHSD7a, AntiDNAJB9
• Tipificación amiloide: cadenas ligeras, amiloide A, TTR
• Microscopia electrónica de transmisión

 

Inmunofluorescencia directa cutánea

 

Mediante la inmunofluorescencia directa se puede identificar la expresión de las inmunoglobulinas, las cadenas ligeras Kappa y Lambda, factores del sistema de complemento o fibrinógeno sobre tejido congelado. En dermatopatología, la inmunofluorescencia directa cutánea es de gran utilidad en el diagnóstico de las enfermedades cutáneas autoinmunes, enfermedades ampollosas autoinmunes, vasculitis cutáneas y sistémicas, liquen plano y alopecias cicatriciales.

Adicionalmente se realiza el mapeo antigénico de la membrana dermo-epidérmica para el diagnóstico de las epidermólisis ampollosas hereditarias utilizando un panel de anticuerpos monoclonales dirigidos contra la laminina 332, colágenos IV y VII, integrina β4 e integrina α6.

 

Determinación de PD-L1

 

PD-L1 es una proteína que ayuda a que las células inmunes no ataquen a las células que la expresan. Algunos neoplasias expresan PD-L1 y "engañan" al sistema inmunitario evitando ser detectados y atacados como sustancias extrañas y dañinas. Si un tumor presenta PD-L1, puede que le beneficie el tratamiento con inmunoterapia que estimula al sistema inmunitario del propio paciente para que reconozca y combata las células tumorales.

La prueba que analiza la cantidad de PD-L1 mediante inmunohistoquímica se usa para averiguar si la inmunoterapia podría ser beneficiosa para el tratamiento de determinadas neoplasias como cáncer de pulmón, mama, vejiga urinaria, cabeza y cuello.

 

Determinación de HER2

 

Algunas personas con cáncer de mama o cáncer gástrico presentan un exceso del número de copias del gen HER2 y de la cantidad de proteína que éste produce. Los tumores que cumplen con esta condición se consideran positivos para HER2. Estos cánceres tienden a crecer y propagarse más rápido que otros tipos de cáncer, pero pueden responder al tratamiento con fármacos dirigidos que tienen como diana a HER2.

La amplificación de gen HER2 se puede determinar mediante estudio inmunohistoquímico o ISH en muestras tanto histológicas como de citología

 

Consulta diagnóstica de lesiones melanocíticas complejas

 

No siempre es fácil distinguir entre una lesión melanocítica inusual pero no neoplásica y un melanoma. Para ello disponemos de las técnicas de diagnóstico más avanzadas que pueden ayudar a evaluar con precisión un tumor. Los patólogos y otros expertos que realizan estas pruebas se centran en el cuidado del cáncer de piel y del melanoma en particular. Tenemos la experiencia necesaria para garantizar que nuestros usuarios reciban un diagnóstico correcto para personalizar su atención en la medida de lo posible

FISH

Las pruebas moleculares, como la hibridación fluorescente in situ (FISH) se utilizan para analizar el ADN de lesiones melanocíticas sospechosas en la piel y ayudar a realizar diagnósticos difíciles. Son especialmente útiles para diagnosticar el melanoma nevoide y el melanoma spitzoide que pueden parecer tumores cutáneos benignos al microscopio.

Pruebas genómicas para el melanoma avanzado

Las pruebas genómicas también se denominan secuenciación del tumor o perfil molecular. Consiste en examinar las células obtenidas del melanoma para ver si existen mutaciones genéticas (cambios en los genes) que puedan estar relacionadas con este tipo de cáncer.

En el caso de las personas con enfermedad avanzada, nuestros expertos utilizan la prueba Oncomine Focus. Esta prueba busca mutaciones, indels y CNV en 52 genes a la vez. También realizamos en pocas horas el test genético Idylla para la detección de mutaciones en BRAF.

En función de las mutaciones que encontremos, podremos recomendar una terapia dirigida que haya sido aprobada para los cambios específicos del tumor.

La información genética sobre el tumor también nos ayuda a predecir las posibilidades de que el cáncer regrese después del tratamiento y a evitar los tratamientos que no funcionen.

 

Caracterización de MSI, BRAF, EGFR y RAS

 

Las pruebas IdyllaTM sirven para la detección de mutaciones en los genes KRAS, NRAS-BRAF, EGFR y la detección de inestabilidad de microsatélites en muestras de tejido parafinado, citología o biopsias líquidas y ofrecen un proceso totalmente automatizado, rápido y de fácil interpretación.

 

Next Generation Sequencing en Hematopatología (paneles para neoplasias hematológicas)

 

Nuestro laboratorio ha sido pionero en la implementación de la tecnología de NGS en el diagnóstico hematopatológico. Actualmente, disponemos de diferentes paneles de NGS específicos según el tipo de patología.

Para la caracterización molecular de las neoplasias mieloides, utilizamos el panel de NGS Oncomine Myeloid Research Assay (ThermoFisher Scientific), que permite evaluar tanto la presencia de las mutaciones como de los genes de fusión más relevantes en este tipo de entidades, incluyendo no solo a la leucemia mieloide aguda sino también a los síndromes mielodisplásicos y a las neoplasias mieloproliferativas. Este panel analiza mutaciones de 40 genes y 29 genes implicados en fusiones, y en concreto cubre toda la región codificante de 17 genes (ASXL1, BCOR, CALR, CEBPA, ETV6, EZH2, IKZF1, NF1, PHF6, PRPF8, RB1, RUNX1, SH2B3, STAG2, TET2, TP53 y ZRSR2), las regiones “hotspot” de 23 genes (ABL1, BRAF, CBL, CSF3R, DNMT3A, FLT3, GATA2, HRAS, IDH1, IDH2, JAK2, KIT, KRAS, MPL, MYD88, NPM1, NRAS, PTPN11, SETBP1, SF3B1, SRSF2, U2AF1 y WT1) y todos los genes de fusiones conocidos de 29 drivers (ABL1, ALK, BCL2, BRAF, CCND1, CREBBP, EGFR, ETV6, FGFR1, FGFR2, FUS, HMGA2, JAK2, KMT2A (MLL), MECOM, MET, MLLT10, MLLT3, MYBL1, MYH11, NTRK3, NUP214, PDGFRA, PDGFRB, RARA, RBM15, RUNX1, TCF3 y TFE3).

En el caso de las neoplasias linfoides, disponemos de dos paneles de NGS. Por una parte, el panel de NGS Lymphoma Solution (Sophia Genetics) incluye el análisis de 54 genes recurrentemente alterados en neoplasias linfoides de células B, y está optimizado para DNA obtenido a partir de material fijado e incluido en parafina. En concreto, el panel cubre toda la región codificante de los siguientes genes: ARID1, B2M, BCL2, CCND3, CD58, CHD2, CDKN2A, CDKN2B, CIITA, CXCR4, EP300, FOXO1, GNA13, ID3, IRF4, MAL, MEF2B, MLL, MLL2, MYC, MYD88, NFKBIE, PAX5, PIM1, POT1, PRDM1, PTPN1, REL, SOCS1, TNFAIP3, TNFRSF14 y TP53, y las regiones “hotspot” de ATM, BCL6, BIRC3 , BRAF, BTK, CARD11, CCND1, CD79A, CD79B, CREBBP, EZH2 , FBXW7, KRAS, NOTCH1, NOTCH2, NRAS, PLCG2, PTEN, SF3B1, STAT6, TCF3 y XPO1.

Por otra parte, para el estudio molecular de la leucemia linfática crónica disponemos del panel Chronic Lymphocytic Leukaemia Solution (Sophia Genetics), que detecta alteraciones en 20 genes y regiones cromosómicas frecuentemente implicados en la patogénesis de este tipo de leucemia. Este panel incluye el análisis del estado mutacional del gen de las inmunoglobulinas así como de las mutaciones de TP53 y de los genes relacionados con la resistencia a los nuevos fármacos dirigidos ibrutinib (BTK y PLCG2) y venetoclax (BCL2).

 

PCR Digital

 

La PCR digital es una técnica muy sensible y precisa que permite la detección y cuantificación de ácidos nucleicos. En nuestro laboratorio, disponemos del sistema de PCR digital de Bio-Rad, que se basa en el fraccionamiento de la muestra en droplets o nanogotas, a nivel de las cuales se realiza la amplificación por PCR, y en la lectura individual de estas droplets para obtener de forma muy precisa la cuantificación absoluta de la diana de interés.

En nuestro laboratorio, analizamos mediante PCR digital toda una serie de mutaciones recurrentes que nos sirven como marcadores moleculares al diagnóstico como son JAK2 V617F, KIT D816V y SF3B1 K700E en neoplasias mieloides, MYD88 L265P y BRAF V600E en neoplasias linfoides y GNAS R201H/C y KRAS G12/13 en lesiones quísticas pancreáticas. También estudiamos mediante PCR digital la mutación T315I del gen BCR-ABL1 en leucemia mieloide crónica. Además, hemos implementado la PCR digital para el seguimiento de la enfermedad mínima residual en pacientes con neoplasias mieloides sometidos a tratamientos de alta eficacia. En estos casos, monitorizamos tanto mutaciones recurrentes (como son IDH1 R132 e IDH2 R140Q/R172K) como mutaciones específicas mediante el diseño de ensayos personalizados para cada paciente