Identificació de mutacions somàtiques implicades en els mecanismes de sensibilitat i/o resistència a fàrmacs dirigits a tumors sòlids

Línea de investigación

Investigar i entendre els teixits és la base per entendre les malalties en la seva globalitat

Miriam Cuatrecasas

Cap de Secció Patologia Toràcica, Digestiva i Metabòlica

Presentació

Problema

Les neoplàsies humanes i les malalties inflamatòries tenen uns mecanismes genètics i moleculars implicats en el seu desenvolupament i progressió que es poden conèixer mitjançant tècniques moleculars i digitals aplicades als teixits.

investigació

 

Aproximació

Les plataformes tecnològiques aplicades a la investigació de les malalties inflamatòries i els tumors humans permeten transferir a la pràctica clínica els coneixements generats en la investigació bàsica.

Per aquest motiu, a nivell diagnòstic s'utilitzen tècniques de patologia molecular aplicades, que inclouen genètica, epigenètica, proteòmica, glicòmica i patologia digital amb algorismes d'intel·ligència artificial, microscòpia espectral i confocal ex vivo.

Impacte

Gràcies a la identificació de dianes terapèutiques, el grup ha distingit paràmetres que permeten millorar el diagnòstic i el pronòstic de la malaltia inflamatòria i neoplàstica.

El grup és líder en diagnòstic molecular de carcinoma de pulmó, mama i estadificació molecular ganglionar en càncer colorectal, així com en mecanismes moleculars subjacents als processos inflamatoris cutanis i renals, tècniques de caracterització molecular en melanoma i tumors del sistema nerviós central .

Membres de l'equip

Miriam Cuatrecasas
Iban Aldecoa
Llucia Alos
Paola Cecilia Castell Fernández
Adriana García-Herrera
Carme Mallofre
Alfons Nadal
José Francisco Ramírez
Teresa Ribalta
Adela Saco
Sherley Diaz
Esther Sanfeliu
Cristina Teixit

Publicacions

ERBB2 mRNA Expression and Response to Ado-Trastuzumab Emtansine (T-DM1) in HER2-Positive Breast Cancer.

Griguolo G, Brasó-Maristany F, González-Farré B, Pascual T, Chic N, Saurí T, Kates R, Gluz O, Martínez D, Paré L, Tsvetkova V, Pesantez D, Vidal M, Adamo B, Muñoz M, Galván P, Barberá L,Cuatrecasas M, Christgen M, Kreipe H, Monge-Escartín I, Villagrasa P, Soy D, Giarratano T, Dieci MV, Conte P, Harbeck N, Guarneri V, Prat A. Cancers (Basel). 2020 Jul 14;12(7):1902. doi: 10.3390/cancers12071902.

 

Usefulness of Two Independent DNA and RNA Tissue-Based Multiplex Assays for the Routine Care of Advanced NSCLC Patients.

Marin E, Teixido C, Carmona-Rocha E, Reyes R, Arcocha A, Viñolas N, Rodríguez-Mues M, Cabrera C, Sánchez M, Vollmer I, Castillo S, Muñoz S, Sullivan IG, Rodriguez A, Garcia M, Alos S, Jares P, Martinez A, Prat A, Molina-Vila MÁ, Reguart N. Cancers (Basel). 2020 Apr 30;12(5):1124. doi: 10.3390/cancers12051124.

 

Integrated Analysis of Germline and Tumor DNA Identifies New Candidate Genes Involved in Familial Colorectal Cancer.

Díaz-Gay M, Franch-Expósito S, Arnau-Collell C, Park S, Supek F, Muñoz J, Bonjoch L, Gratacós-Mulleras A, Sánchez-Rojas PA, Esteban-Jurado C, Ocaña T, Cuatrecasas M, Vila-Casadesús M, Lozano JJ, Parra G, Laurie S, Beltran S; EPICOLON Consortium, Castells A, Bujanda L, Cubiella J, Balaguer F, Castellví-Bel S.Cancers (Basel). 2019 Mar 13;11(3):362. doi: 10.3390/cancers11030362.

 

AURKB as a target in non-small cell lung cancer with acquired resistance to anti-EGFR therapy.

Bertran-Alamillo J, Cattan V, Schoumacher M, Codony-Servat J, Giménez-Capitán A, Cantero F, Burbridge M, Rodríguez S, Teixidó C, Roman R, Castellví J, García-Román S, Codony-Servat C, Viteri S, Cardona AF, Karachaliou N, Rosell R, Molina-Vila MA.Nat Commun. 2019 Apr 18;10(1):1812. doi: 10.1038/s41467-019-09734-5.

 

Assessment of a New ROS1 Immunohistochemistry Clone (SP384) for the Identification of ROS1 Rearrangements in Patients with Non-Small Cell Lung Carcinoma: the ROSING Study.

Conde E, Hernandez S, Martinez R, Angulo B, De Castro J, Collazo-Lorduy A, Jimenez B, Muriel A, Mate JL, Moran T, Aranda I, Massuti B, Rojo F, Domine M, Sansano I, Garcia F, Felip E, Mancheño N, Juan O, Sanz J, Gonzalez-Larriba JL, Atienza-Cuevas L, Arriola-Arellano E, Abdulkader I, Garcia-Gonzalez J, Camacho C, Rodriguez-Abreu D, Teixido C, Reguart N, Gonzalez-Piñeiro A, Lazaro-Quintela M, Lozano MD, Gurpide A, Gomez-Roman J, Lopez-Brea M, Pijuan L, Salido M, Arriola E, Company A, Insa A, Esteban-Rodriguez I, Saiz M, Azkona E, Alvarez R, Artal A, Plaza ML, Aguiar D, Enguita AB, Benito A, Paz-Ares L, Garrido P, Lopez-Rios F.J Thorac Oncol. 2019 Dec;14(12):2120-2132. doi: 10.1016/j.jtho.2019.07.005. 

Gene Expression Signature in Surgical Tissues and Endoscopic Biopsies Identifies High-Risk T1 Colorectal Cancers.

Kandimalla R, Ozawa T, Gao F, Wang X, Goel A; T1 Colorectal Cancer Study Group.Gastroenterology. 2019 Jun;156(8):2338-2341.e3. doi: 10.1053/j.gastro.2019.02.027. 

 

Clinical Benefit From BRAF/MEK Inhibition in a Double Non-V600E BRAF Mutant Lung Adenocarcinoma: A Case Report.

Reyes R, Mayo-de-Las-Casas C, Teixidó C, Cabrera C, Marín E, Vollmer I, Jares P, Garzón M, Molina-Vila MÁ, Reguart N.Clin Lung Cancer. 2019 May;20(3):e219-e223. doi: 10.1016/j.cllc.2019.02.022.

 

DYRK1A modulates c-MET in pancreatic ductal adenocarcinoma to drive tumour growth.

Luna J, Boni J, Cuatrecasas M, Bofill-De Ros X, Núñez-Manchón E, Gironella M, Vaquero EC, Arbones ML, de la Luna S, Fillat C.Gut. 2019 Aug;68(8):1465-1476. doi: 10.1136/gutjnl-2018-316128. 

 

Targeted sequencing and molecular profiling of a papillary and cribriform clear cell intrahepatic cholangiocarcinoma reveals absence of selectable mutations.

Aldecoa I, Montironi C, Vargas GM, Nunes DA, Miquel R, Cuatrecasas M.Gastroenterol Hepatol. 2019 Jun-Jul;42(6):374-375. doi: 10.1016/j.gastrohep.2018.08.006. 

 

Accuracy of the Narrow-Band Imaging International Colorectal Endoscopic Classification System in Identification of Deep Invasion in Colorectal Polyps

Puig I, López-Cerón M, Arnau A, Rosiñol Ò, Cuatrecasas M, Herreros-de-Tejada A, Ferrández Á, Serra-Burriel M, Nogales Ó, Vida F, de Castro L, López-Vicente J, Vega P, Álvarez-González MA, González-Santiago J, Hernández-Conde M, Díez-Redondo P, Rivero-Sánchez L, Gimeno-García AZ, Burgos A, García-Alonso FJ, Bustamante-Balén M, Martínez-Bauer E, Peñas B, Pellise M, EndoCAR group, Spanish Gastroenterological Association and the Spanish Digestive Endoscopy Society.

Gastroenterology. 2019 Jan;156(1):75-87. doi: 10.1053/j.gastro.2018.10.004.  

 

DYRK1A modulates c-MET in pancreatic ductal adenocarcinoma to drive tumour growth

Luna J; Boni J; Cuatrecasas M; Bofill-De Ros X; Núñez-Manchón E; Gironella M; Vaquero EC; Arbones ML; De La Luna S; Fillat C.

Gut. 2019 Aug;68(8):1465-1476.  doi: 10.1136/gutjnl-2018-316128.

 

Mitotic polarization of transcription factors during asymmetric division establishes fate of forming cancer cells

Liu Y; Siles L; Lu X; Dean K; Cuatrecasas M; Postigo A; Dean D.

Nat Commun. 2018 Jun 21;9(1):2424.  doi: 10.1038/s41467-018-04663-1.

 

Near-tetraploid cancer cells show chromosome instability triggered by replication stress and exhibit enhanced invasiveness.

Wangsa D, Quintanilla I, Torabi K, Vila-Casadesús M, Ercilla A, Klus G, Yuce Z, Galofré C, Cuatrecasas M, Lozano JJ, Agell N, Cimini D, Castells A, Ried T, Camps J .

FASEB J. 2018 Jul;32(7):3502-3517.  doi: 10.1096/fj.201700247RR.

 

Rare germline copy number variants in colorectal cancer predisposition characterized by exome sequencing analysis

Franch-Expósito S, Esteban-Jurado C, Garre P, Quintanilla I, Duran-Sanchon S, Díaz-Gay M, Bonjoch L, Cuatrecasas M, Samper E, Muñoz J, Ocaña T, Carballal S, López-Cerón M, Castells A,, Vila-Casadesús M, Derdak S, Laurie S, Beltran S, Carvajal J, Bujanda L, Ruiz-Ponte C, Camps J, Gironella M, Lozano JJ, Balaguer F, Cubiella J, Caldés T, Castellví-Bel S EPICOLON consortium.

J Genet Genomics. 2018 Jan 20;45(1):41-45.  doi: 10.1016/j.jgg.2017.12.001.

 

World Endoscopy Organization Consensus Statements on Post-Colonoscopy and Post-Imaging Colorectal Cancer.

Rutter MD, Beintaris I, Valori R, Chiu HM, Corley DA, Cuatrecasas M, Dekker E, Forsberg A, Gore-Booth J, Haug U, Kaminski MF, Matsuda T, Meijer GA, Morris E, Plumb AA, Rabeneck L, Robertson DJ, Schoen RE, Singh H, Tinmouth J, Young GP, Sanduleanu S .

Gastroenterology. 2018 Sep;155(3):909-925.e3.  doi: 10.1053/j.gastro.2018.05.038.

 

Lymph node pooling: A feasible and efficient method of lymph node molecular staging in colorectal carcinoma

Rakislova N., Montironi C., Aldecoa I., Fernandez E., Bombi J., Jimeno M., Balaguer F., Pellise M., Castells A., Cuatrecasas M.

J Transl Med. 2017 Jan 14;15(1):14.  doi: 10.1186/s12967-016-1114-3.

 

Endoscopic tattooing of early colon carcinoma enhances detection of lymph nodes most prone to harbor tumor burden

Aldecoa I, Montironi C, Planell N, Pellise M, Fernandez-Esparrach G, Gines A, Delgado S, Momblan D, Moreira L, Lopez-Ceron M, Rakislova N, Martinez-Palli G, Balust J, Bombi JA, de Lacy A, Castells A, Balaguer F, Cuatrecasas M.

Surg Endosc. 2017 Feb;31(2):723-733.  doi: 10.1007/s00464-016-5026-3.  

 

Increased IFRD1 Expression in Human Colon Cancers Predicts Reduced Patient Survival.

Lewis MA, Sharabash N, Miao ZF, Lyons LN, Piccirillo J, Kallogjeri D, Schootman M, Mutch M, Yan Y, Levin MS, Castells A, Cuatrecasas M, Mills JC, Wang ZN, Rubin DC.

Dig Dis Sci. 2017 Dec;62(12):3460-3467.  doi: 10.1007/s10620-017-4819-0. 

Principals prestacions utilitzades

Anàlisi de les mutacions de BRAF, teixits
Anàlisi de les mutacions d'EGFR, teixit
Anàlisi de les mutacions de KRAS, teixit
Anàlisi MGMT per a tumors cerebrals, teixits
CISH. Virus Epstein-Barr (EBER), bloc parafina
Detecció del Virus del Papil·loma Humà (VPH) per PCR, mostra citològica o  teixit parafinat
Determinació de la inestabilitat en microsatèl·lits en tumors sòlids
Determinació de mutacions de C-KIT, bloc parafina
Determinació de mutacions d'IDH1, bloc parafina
Determinació de mutacions d'IDH2, bloc parafina
Determinació de mutacions del gen PDGFRA, bloc parafina
Determinació de mutacions del promotor de TERT, bloc parafina
Determinació gens de fusió de pulmó per nCounter (Nanostring)
Determinació per tècnica OSNA 
Extracció de DNA / RNA, bloc de parafina
FISH ALK, bloc de parafina
FISH MDM2, bloc de parafina
FISH MET, bloc de parafina
FISH ROS1, bloc de parafina
FISH 1p/19q tumors cerebrals, bloc parafina
HER2 (Immunohistoquímica), bloc parafina
ISH HER2, bloc parafina  
Microsatèl·lits MSH2, MSH6, MLH1, PMS2 (Immunohistoquímica)
P16 en teixit (Immunohistoquímica), bloc parafina
Panell Oncomine Solid Tumor 22 (NGS), DNA tumoral
Test Prosigna, teixit tumoral de mama parafinat

Altres línies estratègiques de recerca